این آموزش که بصورت فایل pdf و در ۶ صفحه تنظیم شده است کار با نرم افزار BioVEC در محیط ویندوز را شرح داده است. شما می توانید نتایج شبیه سازیهای دینامیک مولکولی ذرات دیسک گونه - ذرات کروی - ذرات بیضی گون را نمایش دهید. نتایج شبیه سازیهایی نظیر کریستالهای مایع و درشت دانه نیز قابل نمایش است. پیوند بین ذرات در صورت وجود را نمایش داده و می توان ذرات با قطرهای مختلف را با رنگهای مختلف به نمایش درآورد. این آموزش به همراه فایلهای مرتبط با یک مثال برای دانلود قرار داده شده است. تاریخ انتشار: ۶ فروردین 1395 ...
برای ایجاد پیکربندی اولیه در شبیه سازی مولکولی نیاز به نرم افزار پکمول (Packmol) دارید. این نرم افزار مولکولهای شما را به تعداد دلخواه و با چگالی معین در جعبه شبیه سازی شما قرار می دهد. این آموزش در محیط لینوکس ubuntu بوده و مدت آن ۲۱ دقیقه و حجم آن ۷۲ مگابایت است. فرمت فایل mp4 می باشد. تاریخ انتشار: ۶ فروردین ۱۳۹۵ ...
در این آموزش نحوه دانلود و نصب نرم افزار VMD روی سیستم عامل لینوکس ubuntu به زبان ساده توضیح داده می شود. آموزش به زبان فارسی است. فایل ویدیویی 14 مگابایت حجم دارد و مدت زمان آموزش نیز در حدود 4 دقیقه می باشد. همچنین فرمت ویدیو mp4 است. تاریخ انتشار: ۵ فروردین 1395 ...
(آشنایی با LAMMPS) در این آموزش یک نانولوله کربنی در داخل آب با مدل TIP3P قرار گرفته است و این سیستم به کمک نرم افزار لمپس شبیه سازی شده است. نحوه شبیه سازی گام به گام گفته شده است. در این شبیه سازی از پتانسیل ترکیبی Hybrid استفاده شده است. زمان آموزش ۱ ساعت بوده و تمامی فایلها نیز همراه آموزش تقدیم خواهد شد. این شبیه سازی در سیستم عامل لینوکس ubuntu انجام شده است. ...
در شبیه سازی مولکولی مولکول ها و اتم ها در داخل جعبه شبیه سازی حرکت می کنند و بر اساس برهمکنش های درون و بین مولکولی که با یکدیگر دارند، مولکول ها و اتم های مورد بررسی در راستای رسیدن به کمترین سطح انرژی و تعادل سیستم حرکت می کنند. جابجایی مولکول ها بر اساس الگوریتم های مختلفی انجام می شود که به روش شبیه سازی مولکولی انتخابی بستگی دارد. در این فیلم آموزشی روش دینامیک مولکولی و مونت کارلو بصورت ساده و مختصر بررسی می شود. اولین مرجع تخصصی و جامع شبیه سازی مولکولی (نانوفناوری محاسباتی) در ایران ...